医学数据挖掘是提高医院信息管理水平，为疾病的诊断和治疗提供科学的、准确的决策的需要。分析了医疗数据的特点，并以慢肺阻疾病诊断的数据集为例，阐述了把医疗数据转换成事务数据格式的方法，描述了关联规则挖掘在医疗数据分析中应用所遇到的难题，针对这些难题给出了一些算法的改进措施，并用数据进行测试。结果表明，此算法优于原来算法，它可以减少产生的规则的数量，从而能快速发现有趣的医疗关联规则。