面向生物医学命名实体识别和规范化的多粒度特征融合
作者:
作者单位:

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

基金项目:

科技创新2030—“新一代人工智能”重大项目(2022ZD0119500); 山东省自然科学基金(ZR2022MF319); 山东科技大学青年教师教学拔尖人才培养基金(BJ20211110)


Multi-granularity Feature Fusion for Biomedical Named Entity Recognition and Normalization
Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 增强出版
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    为了从生物医学文献中提取丰富的实体信息及其规范化表达, 提出了一种面向生物医学命名实体和规范化的多粒度特征融合方法(multi-granularity feature fusion approach for biomedical named entity recognition and normalization, MGFFA). 通过整合字符级、词级、概念级的文本信息, 显著增强了模型的学习能力. 同时还包含一个用于存储和综合不同层次信息的记忆库, 以实现对实体及其规范化标签间复杂关系的深入理解. 通过预训练模型的配合使用, MGFFA不仅捕捉了文本的粗粒度语义表示, 还细致分析了构词层面的特征, 从而全面提升了对长跨度实体的识别准确率. 在NCBI和NC5CDR数据集上的实验结果显示, 该模型在总体上优于其他基线模型.

    Abstract:

    To extract rich entity information and normalized expressions from biomedical literature, this study proposes a multi-granularity feature fusion approach for biomedical named entity recognition and normalization (MGFFA). By integrating character-level, word-level, and concept-level textual information, the model significantly enhances its learning capability. It also incorporates a memory bank for storing and synthesizing information from different levels to achieve a deeper understanding of the complex relationships between entities and their normalized labels. With the integration of pre-trained models, MGFFA captures not only coarse-grained semantic representations of text but also conducts detailed analysis at the morphological level, thereby comprehensively improving the recognition accuracy of long-span entities. Experimental results on the NCBI and NC5CDR datasets demonstrate that the model outperforms other baseline models overall.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

刘彤,石昌岭,倪维健.面向生物医学命名实体识别和规范化的多粒度特征融合.计算机系统应用,,():1-10

复制
分享
文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:2024-04-01
  • 最后修改日期:2024-04-29
  • 录用日期:
  • 在线发布日期: 2024-09-27
  • 出版日期:
您是第位访问者
版权所有:中国科学院软件研究所 京ICP备05046678号-3
地址:北京海淀区中关村南四街4号 中科院软件园区 7号楼305房间,邮政编码:100190
电话:010-62661041 传真: Email:csa (a) iscas.ac.cn
技术支持:北京勤云科技发展有限公司

京公网安备 11040202500063号