针对网络异构数据库同步的业务需求，提出一种基于JMS与Web Service整合架构的网络异构数据库同步的解决方案。利用XML语言实现消息的定制，使用Web Service技术实现跨平台的读写数据，在分布式事务处理方面对两阶段提交协议进行了改进，减少了网络之间数据传输量，以及死锁的发生次数，有效保证了分布式平台数据的一致性。实验结果表明这种新方法有效的解决了网络异构数据库的同步问题。